学院下设数学系、应用数学系、计算科学系、统计与运筹系。  

数学研究所和数学实验中心有：  

 “数学、信息与行为”教育部重点实验室    

教育部教育装备数字化研究中心  

北京航空航天大学“复杂系统与科学计算国际研究中心” 

2010年获批教育部应用数学创新团队

华罗庚数学拔尖学生培养基地获批“国家基础学科拔尖学生培养计划2.0”

数学拔尖学生培养模式改革（华罗庚数学实验班）虚拟教研室